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Le systeme biolog et l'analyse ARDRA ' analyse des fragments de restriction de l'adn ribosomal amplifie ' comme outils pour analyser la biodiversite des communautes bacteriennes dans les eaux de procedes des machines a papier

Posted on:2011-04-30Degree:M.ScType:Thesis
University:Universite de Sherbrooke (Canada)Candidate:Prince, VeroniqueFull Text:PDF
GTID:2441390002469414Subject:Biology
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L'industrie des pates et papier est un environnement favorable pour la croissance des microorganismes puisqu'il offre les conditions essentielles a leur developpement tel que d'abondantes sources d'eau et de nutriments. Les communautes microbiennes retrouvees dans les papetieres peuvent varier grandement d'une usine a l'autre puisque chaque usine a son propre approvisionnement en eau et utilise differentes matieres premieres pour la fabrication de leurs produits. La presence des microorganismes peut etre problematique en certaines occasions, particulierement lorsque ceux-ci se regroupent sous la forme de biofilms. Ces depots engendrent des pertes de production considerables puisqu'en se detachant ils peuvent causer des taches ou des trous dans le papier. Finalement, la presence de biofilms peut egalement causer des problemes mecaniques en accelerant la corrosion des metaux et en obstruant la tuyauterie.;L'eau est indispensable dans le processus de fabrication du papier. Elle est utilisee en quantite phenomenale, c'est pourquoi son utilisation est comptabilisee et qu'elle est recyclee au maximum. Le test Biolog semblait etre parfaitement approprie pour l'analyse des variations spatiales et temporelles des communautes microbiennes contaminant le circuit d'eau blanche. L'analyse Biolog du circuit d'eau blanche a permis de detecter des differences entre les communautes microbiennes de la caisse d'arrivee, de l'eau clarifiee, de l'eau des presses et de l'eau blanche recyclee des deux machines a papier canadiennes. Les variations spatiales des communautes sont plus importantes entre les differents sites d'echantillonnage d'une meme machine a papier qu'entre un meme site d'echantillonnage sur deux machines a papier differentes. Finalement, tout comme l'etude des communautes microbiennes effectuee dans le passe par Kashama et al (2009), des variations temporelles ont ete observees en juillet et decembre 2005 pour les echantillons de la caisse d'arrivee.;La connaissance des microorganismes contaminant un environnement papetier est primordiale pour comprendre et identifier les facteurs influencant la structure des communautes microbiennes. L'utilisation d'une methode moleculaire pour caracteriser la communaute bacterienne de la caisse d'arrivee d'une machine a papier canadienne a permis d'identifier de nouveaux genres bacteriens tels Hydrogenophilus, Meiothermus, Tepidimonas, Geobacillus et Rhizobium. Ces genres n'avaient pas ete identifies avec une methode d'isolement employee dans cette papetiere canadienne en 2003. La methode " Amplified Ribosomal DNA Restriction Analysis " a egalement permis d'identifier des variations dans la communaute microbienne selon les saisons. Des genres bacteriens comme Rhizobium et Hydrogenophilus ont ete uniquement identifies au mois de juillet 2006 et la proportion d'individus appartenant au genre Tepidimonas etait plus importante en juillet 2006 comparativement a fevrier 2006. Le profil metabolique des communautes microbiennes de fevrier et juillet 2006 effectue a l'aide de l'analyse Biolog a confirme la variation temporelle entre les populations bacteriennes de la caisse d'arrivee de cette machine a papier canadienne.
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